Uno de los componentes más importantes de las actividades de investigación del Colegio de Ingeniería, es la existencia de varios centros que fomentan un ambiente propicio para la investigación y promueven una cultura investigativa entre profesores, departamentos, estudiantes y personal de apoyo. Estos centros incluyen:

• Tropical Center for Earth and Space Studies (TCESS)
• Program in Research in Computing and Information Sciences and Engineering (PRECISE)
• Center for Subsurface Sensing and Imaging Systems (CenSSIS)
• Center for Power Electronics (CPES)
• Water Resources Research Institute (WRRI)
• Civil Infrastructure Research Center (CIRC)
• Transportation Technology Transfer Center

entre otros. La mayoría de estos centros cubren varias disciplinas, varias universidades y mantienen lazos estrechos con el sector industrial. Los centros han sido una parte integral para el crecimiento de las actividades de investigación del Colegio de Ingeniería.

Durante los próximos cinco años la Oficina del Decano Asociado de Investigación se enfocará en exaltar y facilitar actividades de investigación que cubran varias disciplinas no solo entre los departamentos del Colegio de Ingeniería pero también entre los otros Decanatos Académicos de la UPRM. Esto abarcará no solo la expansión y re-enfoque de la infraestructura de apoyo administrativo, pero también el desarrollo de un portfolio de investigación que establezca las áreas estratégicas consistentes con la misión y dirección de la Universidad de Puerto Rico.

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